В задание учреждения от его учредителя — областного департамента социальной защиты населения — включено три сервисных компонента: социальное стационарное обслуживание общего типа граждан пожилого возраста и инвалидов, социальная стационарная реабилитация несовершеннолетних, оказавшихся в трудной жизненной ситуации, и социальный патронаж неблагополучных семей. Помимо этого центр намерен участвовать в конкурсах на санаторно-оздоровительное обслуживание населения, проводимых областным фондом социального страхования. Также в планах автономного учреждения — оказывать санаторно-оздоровительные услуги населению на платной основе.
Переход в форму автономного учреждения позволит повысить прозрачность бюджетного финансирования (финансироваться будет не просто деятельность центра, а конкретное задание на оказание услуг), значительно упростить управленческие процедуры, а также создать более благоприятные условия для увеличения внебюджетных доходов учреждения. Центр «Чайка» стал первым на Дальнем Востоке автономным учреждением социального обслуживания. В 2008 году этот новый статус также приобрело еще одно государственное учреждение — учреждение культуры «Сахалинский международный театральный центр им. А.П.Чехова».
Преобразование центра «Чайка» в автономное учреждение было осуществлено при консультационно-методической поддержке Фонда «Институт экономики города» в рамках программы «Социально-экономическое развитие и управление на местном уровне: новое качество роста», осуществляемой при поддержке Агентства США по международному развитию.
